Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDPQ00604 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDPQ00604 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDPQ00604 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDPQ00604 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDPQ00604 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDPQ00604 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDPQ00604 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDPQ00604 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDPQ00604 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDPQ00604 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDPQ00604 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDPQ00604 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDPQ00604 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDPQ00604 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDPQ00604 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDPQ00604 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms