Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms