Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFI35P80217 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IFI35P80217 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFI35P80217 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFI35P80217 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFI35P80217 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFI35P80217 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFI35P80217 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFI35P80217 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFI35P80217 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFI35P80217 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFI35P80217 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFI35P80217 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFI35P80217 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFI35P80217 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFI35P80217 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFI35P80217 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFI35P80217 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFI35P80217 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IFI35P80217 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IFI35P80217 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFI35P80217 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFI35P80217 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFI35P80217 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFI35P80217 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFI35P80217 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFI35P80217 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IFI35P80217 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFI35P80217 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFI35P80217 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFI35P80217 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFI35P80217 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFI35P80217 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFI35P80217 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFI35P80217 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms