Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRX1P78414 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRX1P78414 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IRX1P78414 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRX1P78414 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRX1P78414 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRX1P78414 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRX1P78414 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRX1P78414 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRX1P78414 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRX1P78414 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRX1P78414 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRX1P78414 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRX1P78414 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRX1P78414 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRX1P78414 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRX1P78414 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRX1P78414 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRX1P78414 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRX1P78414 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRX1P78414 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRX1P78414 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRX1P78414 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRX1P78414 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IRX1P78414 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRX1P78414 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRX1P78414 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRX1P78414 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRX1P78414 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IRX1P78414 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRX1P78414 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRX1P78414 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRX1P78414 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRX1P78414 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRX1P78414 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRX1P78414 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
IRX1P78414 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRX1P78414 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRX1P78414 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRX1P78414 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRX1P78414 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRX1P78414 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IRX1P78414 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRX1P78414 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRX1P78414 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRX1P78414 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRX1P78414 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRX1P78414 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRX1P78414 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRX1P78414 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRX1P78414 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRX1P78414 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRX1P78414 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRX1P78414 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRX1P78414 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRX1P78414 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRX1P78414 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRX1P78414 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRX1P78414 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRX1P78414 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRX1P78414 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms