Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VBP1P61758 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VBP1P61758 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VBP1P61758 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VBP1P61758 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VBP1P61758 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VBP1P61758 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VBP1P61758 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VBP1P61758 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VBP1P61758 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VBP1P61758 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VBP1P61758 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VBP1P61758 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VBP1P61758 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VBP1P61758 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VBP1P61758 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VBP1P61758 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VBP1P61758 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VBP1P61758 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VBP1P61758 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VBP1P61758 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VBP1P61758 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VBP1P61758 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VBP1P61758 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VBP1P61758 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms