Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN1P60606 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN1P60606 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms