Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms