Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC01547P58512 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms