Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms