Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB3P54284 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms