Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 RPL11AYPR102C 525 nt2.97□□□□□ -1.93
HEF3P53978 YPR170CYPR170C 336 nt2.97□□□□□ -1.93
HEF3P53978 SEC66YBR171W 621 nt2.97□□□□□ -1.93
HEF3P53978 CYR1YJL005W 6081 nt2.97□□□□□ -1.93
HEF3P53978 MNT3YIL014W 1893 nt2.96□□□□□ -1.93
HEF3P53978 YCR064CYCR064C 411 nt2.96□□□□□ -1.94
HEF3P53978 snR9snR9 187 nt2.96□□□□□ -1.94
HEF3P53978 RSM24YDR175C 960 nt2.96□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YJL169WYJL169W 369 nt2.96□□□□□ -1.94
HEF3P53978 SRP21YKL122C 504 nt2.96□□□□□ -1.94
HEF3P53978 VPS63YLR261C 327 nt2.96□□□□□ -1.94
HEF3P53978 RPL16BYNL069C 597 nt2.96□□□□□ -1.94
HEF3P53978 AIM4YBR194W 372 nt2.96□□□□□ -1.94
HEF3P53978 MET5YJR137C 4329 nt2.96□□□□□ -1.94
HEF3P53978 TOM1YDR457W 9807 nt2.96□□□□□ -1.94
HEF3P53978 HOP1YIL072W 1818 nt2.96□□□□□ -1.94
HEF3P53978 KIN82YCR091W 2163 nt2.95□□□□□ -1.94
HEF3P53978 VTC3YPL019C 2508 nt2.95□□□□□ -1.94
HEF3P53978 DUF1YOL087C 3351 nt2.95□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YDR018CYDR018C 1191 nt2.95□□□□□ -1.94
HEF3P53978 MIC19YFR011C 513 nt2.95□□□□□ -1.94
HEF3P53978 BUD19YJL188C 309 nt2.95□□□□□ -1.94
HEF3P53978 TMA10YLR327C 261 nt2.95□□□□□ -1.94
HEF3P53978 GMC2YLR445W 567 nt2.95□□□□□ -1.94
HEF3P53978 EXO84YBR102C 2262 nt2.95□□□□□ -1.94
HEF3P53978 STI1YOR027W 1770 nt2.95□□□□□ -1.94
HEF3P53978 SNA4YDL123W 423 nt2.94□□□□□ -1.94
HEF3P53978 DAD1YDR016C 285 nt2.94□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YDR029WYDR029W 315 nt2.94□□□□□ -1.94
HEF3P53978 GET1YGL020C 708 nt2.94□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.94□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.94□□□□□ -1.94
HEF3P53978 BET3YKR068C 582 nt2.94□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YPL142CYPL142C 318 nt2.94□□□□□ -1.94
HEF3P53978 BNI4YNL233W 2679 nt2.94□□□□□ -1.94
HEF3P53978 GCD10YNL062C 1437 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YER138CYER138C 5268 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YER160CYER160C 5268 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YJR027WYJR027W 5268 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YML039WYML039W 5268 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YML045WYML045W 5268 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YMR050CYMR050C 5268 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 PDC2YDR081C 2778 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 VMA8YEL051W 771 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 ADI1YMR009W 540 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 RPS16AYMR143W 432 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 NTC20YBR188C 423 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 SLH1YGR271W 5904 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 SVL3YPL032C 2478 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt2.93□□□□□ -1.94
HEF3P53978 SHS1YDL225W 1656 nt2.92□□□□□ -1.94
HEF3P53978 TDA2YER071C 381 nt2.92□□□□□ -1.94
HEF3P53978 RLP24YLR009W 600 nt2.92□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YLR202CYLR202C 327 nt2.92□□□□□ -1.94
HEF3P53978 PDS5YMR076C 3834 nt2.92□□□□□ -1.94
HEF3P53978 MPP6YNR024W 561 nt2.92□□□□□ -1.94
HEF3P53978 ARF3YOR094W 552 nt2.92□□□□□ -1.94
HEF3P53978 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.92□□□□□ -1.94
HEF3P53978 CTF13YMR094W 1437 nt2.92□□□□□ -1.94
HEF3P53978 DIA2YOR080W 2199 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 APL5YPL195W 2799 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 PUF6YDR496C 1971 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 CRD1YDL142C 852 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 FAR7YFR008W 666 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 APQ13YJL075C 417 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YJL119CYJL119C 324 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 LSM8YJR022W 330 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 SRL3YKR091W 741 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YLR076CYLR076C 423 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 CCW14YLR390W-A 717 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YMR187CYMR187C 1296 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YBR051WYBR051W 351 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YBR071WYBR071W 636 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 KHA1YJL094C 2622 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YEF3YLR249W 3135 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 VHR1YIL056W 1923 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 NFT1YKR103W 3657 nt2.91□□□□□ -1.94
HEF3P53978 YDR338CYDR338C 2088 nt2.9□□□□□ -1.95
HEF3P53978 NCB2YDR397C 441 nt2.9□□□□□ -1.95
HEF3P53978 SLX9YGR081C 633 nt2.9□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YGR293CYGR293C 462 nt2.9□□□□□ -1.95
HEF3P53978 ATP18YML081C-A 180 nt2.9□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YBR062CYBR062C 543 nt2.9□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YPR172WYPR172W 603 nt2.9□□□□□ -1.95
HEF3P53978 MED1YPR070W 1701 nt2.9□□□□□ -1.95
HEF3P53978 NEL1YHR035W 1893 nt2.9□□□□□ -1.95
HEF3P53978 STN1YDR082W 1485 nt2.9□□□□□ -1.95
HEF3P53978 ADY4YLR227C 1482 nt2.9□□□□□ -1.95
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