Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms