Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCNKBP51801 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms