Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP11P51784 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP11P51784 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP11P51784 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP11P51784 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP11P51784 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP11P51784 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP11P51784 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP11P51784 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP11P51784 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP11P51784 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP11P51784 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP11P51784 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP11P51784 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP11P51784 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP11P51784 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP11P51784 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP11P51784 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP11P51784 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP11P51784 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP11P51784 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP11P51784 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP11P51784 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP11P51784 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP11P51784 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP11P51784 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP11P51784 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP11P51784 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP11P51784 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP11P51784 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP11P51784 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP11P51784 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP11P51784 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP11P51784 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP11P51784 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP11P51784 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP11P51784 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP11P51784 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP11P51784 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP11P51784 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP11P51784 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP11P51784 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP11P51784 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP11P51784 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP11P51784 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP11P51784 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP11P51784 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP11P51784 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP11P51784 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP11P51784 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP11P51784 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP11P51784 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP11P51784 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP11P51784 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP11P51784 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP11P51784 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP11P51784 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP11P51784 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP11P51784 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP11P51784 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP11P51784 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP11P51784 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP11P51784 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP11P51784 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP11P51784 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP11P51784 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP11P51784 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP11P51784 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP11P51784 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP11P51784 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP11P51784 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP11P51784 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP11P51784 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP11P51784 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP11P51784 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP11P51784 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP11P51784 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP11P51784 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP11P51784 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP11P51784 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP11P51784 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP11P51784 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP11P51784 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP11P51784 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP11P51784 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP11P51784 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP11P51784 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP11P51784 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP11P51784 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP11P51784 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP11P51784 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP11P51784 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP11P51784 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP11P51784 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP11P51784 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP11P51784 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP11P51784 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP11P51784 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP11P51784 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP11P51784 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms