Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAMP50895 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAMP50895 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAMP50895 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAMP50895 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAMP50895 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAMP50895 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAMP50895 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAMP50895 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAMP50895 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAMP50895 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAMP50895 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAMP50895 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAMP50895 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAMP50895 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAMP50895 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAMP50895 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAMP50895 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAMP50895 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAMP50895 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAMP50895 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAMP50895 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAMP50895 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAMP50895 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAMP50895 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAMP50895 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAMP50895 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAMP50895 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAMP50895 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAMP50895 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAMP50895 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAMP50895 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAMP50895 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAMP50895 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAMP50895 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAMP50895 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAMP50895 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAMP50895 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAMP50895 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAMP50895 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAMP50895 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAMP50895 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAMP50895 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAMP50895 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAMP50895 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAMP50895 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAMP50895 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAMP50895 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAMP50895 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAMP50895 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAMP50895 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAMP50895 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAMP50895 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAMP50895 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAMP50895 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAMP50895 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAMP50895 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAMP50895 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAMP50895 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAMP50895 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAMP50895 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAMP50895 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAMP50895 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAMP50895 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAMP50895 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAMP50895 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCAMP50895 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCAMP50895 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCAMP50895 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCAMP50895 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCAMP50895 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCAMP50895 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCAMP50895 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCAMP50895 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAMP50895 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAMP50895 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAMP50895 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAMP50895 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAMP50895 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAMP50895 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAMP50895 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAMP50895 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAMP50895 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAMP50895 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAMP50895 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAMP50895 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAMP50895 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCAMP50895 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms