Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTPAP49638 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTPAP49638 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTPAP49638 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTPAP49638 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTPAP49638 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTPAP49638 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTPAP49638 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTPAP49638 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTPAP49638 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTPAP49638 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTPAP49638 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTPAP49638 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTPAP49638 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTPAP49638 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTPAP49638 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTPAP49638 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTPAP49638 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTPAP49638 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTPAP49638 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTPAP49638 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTPAP49638 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTPAP49638 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTPAP49638 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTPAP49638 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTPAP49638 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTPAP49638 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTPAP49638 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTPAP49638 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTPAP49638 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTPAP49638 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTPAP49638 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTPAP49638 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTPAP49638 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTPAP49638 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTPAP49638 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTPAP49638 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTPAP49638 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTPAP49638 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTPAP49638 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTPAP49638 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTPAP49638 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TTPAP49638 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTPAP49638 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTPAP49638 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTPAP49638 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTPAP49638 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTPAP49638 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTPAP49638 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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