Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GABRB2P47870 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB2P47870 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms