Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP2P46087 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP2P46087 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP2P46087 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP2P46087 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP2P46087 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP2P46087 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP2P46087 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP2P46087 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP2P46087 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP2P46087 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP2P46087 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP2P46087 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP2P46087 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP2P46087 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP2P46087 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP2P46087 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP2P46087 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP2P46087 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP2P46087 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOP2P46087 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOP2P46087 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOP2P46087 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOP2P46087 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOP2P46087 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NOP2P46087 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOP2P46087 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOP2P46087 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOP2P46087 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP2P46087 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP2P46087 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP2P46087 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP2P46087 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP2P46087 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP2P46087 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP2P46087 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP2P46087 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP2P46087 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP2P46087 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP2P46087 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP2P46087 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP2P46087 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP2P46087 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP2P46087 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP2P46087 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP2P46087 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP2P46087 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP2P46087 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP2P46087 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP2P46087 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP2P46087 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP2P46087 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP2P46087 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP2P46087 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP2P46087 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP2P46087 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP2P46087 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP2P46087 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP2P46087 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP2P46087 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms