Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGCXP38435 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGCXP38435 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGCXP38435 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGCXP38435 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGCXP38435 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGCXP38435 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGCXP38435 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGCXP38435 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGCXP38435 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGCXP38435 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGCXP38435 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGCXP38435 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGCXP38435 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGCXP38435 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGCXP38435 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGCXP38435 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGCXP38435 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGCXP38435 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGCXP38435 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGCXP38435 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGCXP38435 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGCXP38435 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGCXP38435 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGCXP38435 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGCXP38435 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GGCXP38435 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGCXP38435 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGCXP38435 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGCXP38435 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGCXP38435 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGCXP38435 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGCXP38435 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GGCXP38435 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GGCXP38435 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GGCXP38435 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GGCXP38435 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GGCXP38435 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGCXP38435 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGCXP38435 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGCXP38435 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGCXP38435 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGCXP38435 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGCXP38435 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGCXP38435 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGCXP38435 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGCXP38435 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGCXP38435 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GGCXP38435 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGCXP38435 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGCXP38435 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGCXP38435 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGCXP38435 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGCXP38435 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGCXP38435 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGCXP38435 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGCXP38435 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGCXP38435 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGCXP38435 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGCXP38435 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGCXP38435 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGCXP38435 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms