Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETFBP38117 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETFBP38117 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETFBP38117 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETFBP38117 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ETFBP38117 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ETFBP38117 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ETFBP38117 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ETFBP38117 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ETFBP38117 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ETFBP38117 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ETFBP38117 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms