Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBRP36941 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBRP36941 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBRP36941 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTBRP36941 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTBRP36941 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTBRP36941 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTBRP36941 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBRP36941 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBRP36941 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBRP36941 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBRP36941 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBRP36941 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBRP36941 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBRP36941 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBRP36941 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBRP36941 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBRP36941 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBRP36941 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBRP36941 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBRP36941 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBRP36941 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBRP36941 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBRP36941 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBRP36941 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBRP36941 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBRP36941 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBRP36941 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBRP36941 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBRP36941 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBRP36941 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBRP36941 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBRP36941 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBRP36941 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBRP36941 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBRP36941 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBRP36941 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBRP36941 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBRP36941 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBRP36941 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBRP36941 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBRP36941 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBRP36941 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBRP36941 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBRP36941 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBRP36941 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBRP36941 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBRP36941 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBRP36941 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBRP36941 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBRP36941 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBRP36941 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBRP36941 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms