Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1CAMP32004 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1CAMP32004 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
L1CAMP32004 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1CAMP32004 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1CAMP32004 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
L1CAMP32004 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1CAMP32004 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1CAMP32004 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1CAMP32004 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
L1CAMP32004 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
L1CAMP32004 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
L1CAMP32004 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
L1CAMP32004 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1CAMP32004 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms