Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPS1P31327 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPS1P31327 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPS1P31327 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CPS1P31327 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CPS1P31327 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPS1P31327 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPS1P31327 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPS1P31327 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPS1P31327 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPS1P31327 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPS1P31327 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPS1P31327 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPS1P31327 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPS1P31327 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPS1P31327 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPS1P31327 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPS1P31327 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPS1P31327 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPS1P31327 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPS1P31327 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPS1P31327 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPS1P31327 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPS1P31327 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPS1P31327 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPS1P31327 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CPS1P31327 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CPS1P31327 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPS1P31327 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPS1P31327 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPS1P31327 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CPS1P31327 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CPS1P31327 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CPS1P31327 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CPS1P31327 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
CPS1P31327 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CPS1P31327 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CPS1P31327 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CPS1P31327 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CPS1P31327 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CPS1P31327 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPS1P31327 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPS1P31327 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPS1P31327 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPS1P31327 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPS1P31327 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPS1P31327 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPS1P31327 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPS1P31327 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPS1P31327 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPS1P31327 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPS1P31327 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPS1P31327 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPS1P31327 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPS1P31327 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPS1P31327 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPS1P31327 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPS1P31327 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPS1P31327 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPS1P31327 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPS1P31327 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPS1P31327 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPS1P31327 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPS1P31327 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPS1P31327 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPS1P31327 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPS1P31327 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CPS1P31327 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPS1P31327 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPS1P31327 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPS1P31327 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPS1P31327 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CPS1P31327 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CPS1P31327 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CPS1P31327 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CPS1P31327 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CPS1P31327 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CPS1P31327 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CPS1P31327 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPS1P31327 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPS1P31327 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPS1P31327 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPS1P31327 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPS1P31327 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPS1P31327 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPS1P31327 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPS1P31327 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPS1P31327 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPS1P31327 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPS1P31327 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPS1P31327 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPS1P31327 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPS1P31327 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPS1P31327 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CPS1P31327 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CPS1P31327 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CPS1P31327 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CPS1P31327 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CPS1P31327 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CPS1P31327 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms