Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms