Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms