Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms