Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B4P23634 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms