Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA6P23229 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA6P23229 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms