Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP1P21291 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSRP1P21291 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms