Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDCP19113 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDCP19113 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDCP19113 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDCP19113 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDCP19113 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDCP19113 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDCP19113 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDCP19113 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDCP19113 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDCP19113 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDCP19113 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDCP19113 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDCP19113 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDCP19113 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDCP19113 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDCP19113 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDCP19113 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDCP19113 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDCP19113 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDCP19113 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDCP19113 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDCP19113 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDCP19113 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDCP19113 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDCP19113 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDCP19113 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDCP19113 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDCP19113 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDCP19113 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDCP19113 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HDCP19113 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDCP19113 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDCP19113 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDCP19113 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDCP19113 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HDCP19113 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDCP19113 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDCP19113 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDCP19113 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDCP19113 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDCP19113 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDCP19113 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDCP19113 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HDCP19113 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDCP19113 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDCP19113 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDCP19113 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDCP19113 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDCP19113 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDCP19113 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDCP19113 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDCP19113 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDCP19113 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDCP19113 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDCP19113 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDCP19113 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDCP19113 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDCP19113 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDCP19113 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms