Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CFTRP13569 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFTRP13569 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CFTRP13569 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CFTRP13569 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFTRP13569 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFTRP13569 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFTRP13569 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFTRP13569 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFTRP13569 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFTRP13569 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFTRP13569 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFTRP13569 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFTRP13569 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFTRP13569 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CFTRP13569 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CFTRP13569 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CFTRP13569 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CFTRP13569 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CFTRP13569 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFTRP13569 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFTRP13569 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFTRP13569 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFTRP13569 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFTRP13569 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFTRP13569 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFTRP13569 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFTRP13569 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFTRP13569 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFTRP13569 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFTRP13569 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CFTRP13569 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CFTRP13569 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CFTRP13569 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CFTRP13569 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CFTRP13569 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CFTRP13569 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CFTRP13569 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CFTRP13569 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CFTRP13569 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CFTRP13569 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CFTRP13569 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CFTRP13569 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CFTRP13569 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CFTRP13569 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CFTRP13569 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CFTRP13569 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CFTRP13569 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CFTRP13569 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFTRP13569 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFTRP13569 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFTRP13569 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFTRP13569 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFTRP13569 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFTRP13569 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFTRP13569 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFTRP13569 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFTRP13569 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFTRP13569 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFTRP13569 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFTRP13569 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFTRP13569 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFTRP13569 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFTRP13569 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFTRP13569 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFTRP13569 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFTRP13569 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFTRP13569 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFTRP13569 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFTRP13569 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
CFTRP13569 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFTRP13569 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFTRP13569 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFTRP13569 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFTRP13569 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFTRP13569 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFTRP13569 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFTRP13569 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFTRP13569 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFTRP13569 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFTRP13569 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFTRP13569 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFTRP13569 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFTRP13569 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFTRP13569 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFTRP13569 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFTRP13569 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFTRP13569 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFTRP13569 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFTRP13569 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFTRP13569 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFTRP13569 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFTRP13569 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFTRP13569 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFTRP13569 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFTRP13569 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFTRP13569 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFTRP13569 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFTRP13569 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFTRP13569 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms