Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKBP12277 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKBP12277 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKBP12277 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKBP12277 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKBP12277 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKBP12277 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKBP12277 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKBP12277 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKBP12277 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKBP12277 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKBP12277 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKBP12277 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKBP12277 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKBP12277 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKBP12277 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CKBP12277 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CKBP12277 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CKBP12277 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKBP12277 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKBP12277 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKBP12277 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CKBP12277 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKBP12277 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKBP12277 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKBP12277 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKBP12277 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKBP12277 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKBP12277 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKBP12277 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKBP12277 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKBP12277 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKBP12277 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKBP12277 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKBP12277 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKBP12277 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CKBP12277 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKBP12277 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKBP12277 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKBP12277 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKBP12277 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKBP12277 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKBP12277 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKBP12277 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKBP12277 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKBP12277 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKBP12277 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKBP12277 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKBP12277 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKBP12277 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKBP12277 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKBP12277 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKBP12277 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKBP12277 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKBP12277 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKBP12277 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms