Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1P11387 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1P11387 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1P11387 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1P11387 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1P11387 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1P11387 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1P11387 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1P11387 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1P11387 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1P11387 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1P11387 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1P11387 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1P11387 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1P11387 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1P11387 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1P11387 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1P11387 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP1P11387 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1P11387 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1P11387 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1P11387 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1P11387 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1P11387 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1P11387 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1P11387 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1P11387 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1P11387 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1P11387 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1P11387 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP1P11387 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1P11387 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1P11387 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1P11387 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1P11387 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1P11387 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1P11387 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1P11387 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1P11387 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1P11387 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1P11387 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1P11387 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1P11387 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1P11387 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1P11387 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1P11387 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1P11387 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1P11387 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1P11387 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1P11387 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1P11387 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1P11387 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1P11387 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1P11387 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1P11387 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1P11387 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1P11387 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1P11387 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1P11387 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1P11387 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1P11387 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1P11387 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1P11387 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1P11387 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1P11387 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1P11387 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1P11387 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1P11387 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1P11387 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1P11387 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1P11387 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms