Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC192P0DO97 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms