Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGA3P0DJD8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms