Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms