Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms