Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
C4AP0C0L4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms