Protein–RNA interactions for Protein: P09630

HOXC6, Homeobox protein Hox-C6, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6P09630 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXC6P09630 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms