Protein–RNA interactions for Protein: P08603

CFH, Complement factor H, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHP08603 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFHP08603 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFHP08603 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHP08603 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHP08603 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHP08603 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHP08603 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHP08603 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHP08603 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHP08603 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHP08603 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHP08603 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHP08603 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHP08603 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFHP08603 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHP08603 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHP08603 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHP08603 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHP08603 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHP08603 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHP08603 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHP08603 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHP08603 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHP08603 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHP08603 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHP08603 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHP08603 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHP08603 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHP08603 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHP08603 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHP08603 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFHP08603 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHP08603 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHP08603 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHP08603 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHP08603 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHP08603 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHP08603 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHP08603 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHP08603 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFHP08603 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CFHP08603 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CFHP08603 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CFHP08603 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFHP08603 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHP08603 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHP08603 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHP08603 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHP08603 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHP08603 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHP08603 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHP08603 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHP08603 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHP08603 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHP08603 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHP08603 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHP08603 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHP08603 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHP08603 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFHP08603 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHP08603 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHP08603 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHP08603 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHP08603 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHP08603 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHP08603 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHP08603 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHP08603 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHP08603 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHP08603 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHP08603 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHP08603 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHP08603 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHP08603 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHP08603 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHP08603 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHP08603 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHP08603 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHP08603 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFHP08603 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFHP08603 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFHP08603 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms