Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEFMP07197 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEFMP07197 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEFMP07197 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEFMP07197 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEFMP07197 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NEFMP07197 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEFMP07197 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEFMP07197 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NEFMP07197 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEFMP07197 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEFMP07197 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFMP07197 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEFMP07197 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEFMP07197 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEFMP07197 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEFMP07197 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NEFMP07197 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEFMP07197 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEFMP07197 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEFMP07197 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NEFMP07197 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEFMP07197 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NEFMP07197 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEFMP07197 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NEFMP07197 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NEFMP07197 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NEFMP07197 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEFMP07197 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFMP07197 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFMP07197 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFMP07197 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFMP07197 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NEFMP07197 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFMP07197 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NEFMP07197 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NEFMP07197 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NEFMP07197 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFMP07197 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NEFMP07197 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFMP07197 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFMP07197 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NEFMP07197 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFMP07197 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEFMP07197 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEFMP07197 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEFMP07197 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEFMP07197 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEFMP07197 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEFMP07197 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NEFMP07197 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NEFMP07197 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NEFMP07197 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEFMP07197 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEFMP07197 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEFMP07197 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEFMP07197 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NEFMP07197 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFMP07197 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFMP07197 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFMP07197 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFMP07197 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFMP07197 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFMP07197 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFMP07197 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFMP07197 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFMP07197 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFMP07197 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFMP07197 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFMP07197 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFMP07197 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFMP07197 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFMP07197 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFMP07197 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFMP07197 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFMP07197 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFMP07197 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFMP07197 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms