Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms