Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTNP04004 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTNP04004 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTNP04004 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTNP04004 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTNP04004 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTNP04004 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTNP04004 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTNP04004 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VTNP04004 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTNP04004 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VTNP04004 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTNP04004 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTNP04004 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTNP04004 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTNP04004 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTNP04004 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTNP04004 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTNP04004 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTNP04004 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTNP04004 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTNP04004 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTNP04004 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTNP04004 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTNP04004 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTNP04004 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTNP04004 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTNP04004 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTNP04004 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTNP04004 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTNP04004 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTNP04004 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTNP04004 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VTNP04004 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTNP04004 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTNP04004 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTNP04004 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTNP04004 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTNP04004 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTNP04004 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTNP04004 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTNP04004 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VTNP04004 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTNP04004 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms