Protein–RNA interactions for Protein: P02708

CHRNA1, Acetylcholine receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA1P02708 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA1P02708 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms