Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGPS1O95749 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGPS1O95749 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms