Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNTO95613 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNTO95613 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNTO95613 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNTO95613 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNTO95613 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNTO95613 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNTO95613 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNTO95613 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNTO95613 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNTO95613 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNTO95613 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNTO95613 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNTO95613 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNTO95613 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNTO95613 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNTO95613 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNTO95613 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNTO95613 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNTO95613 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNTO95613 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNTO95613 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNTO95613 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNTO95613 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCNTO95613 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCNTO95613 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCNTO95613 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PCNTO95613 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCNTO95613 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCNTO95613 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCNTO95613 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNTO95613 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNTO95613 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNTO95613 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNTO95613 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNTO95613 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNTO95613 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNTO95613 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNTO95613 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNTO95613 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNTO95613 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNTO95613 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNTO95613 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNTO95613 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNTO95613 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNTO95613 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNTO95613 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNTO95613 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCNTO95613 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCNTO95613 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCNTO95613 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCNTO95613 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCNTO95613 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms