Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC2O95347 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC2O95347 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC2O95347 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC2O95347 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC2O95347 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC2O95347 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC2O95347 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC2O95347 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC2O95347 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC2O95347 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC2O95347 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC2O95347 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC2O95347 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC2O95347 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC2O95347 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC2O95347 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC2O95347 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC2O95347 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC2O95347 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC2O95347 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC2O95347 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC2O95347 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC2O95347 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC2O95347 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC2O95347 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC2O95347 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC2O95347 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC2O95347 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC2O95347 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC2O95347 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC2O95347 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC2O95347 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC2O95347 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC2O95347 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC2O95347 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC2O95347 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC2O95347 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC2O95347 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC2O95347 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC2O95347 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC2O95347 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC2O95347 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC2O95347 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC2O95347 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC2O95347 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC2O95347 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC2O95347 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC2O95347 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC2O95347 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC2O95347 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC2O95347 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC2O95347 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC2O95347 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC2O95347 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC2O95347 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC2O95347 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC2O95347 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC2O95347 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC2O95347 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC2O95347 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC2O95347 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC2O95347 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC2O95347 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC2O95347 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SMC2O95347 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
SMC2O95347 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC2O95347 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC2O95347 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC2O95347 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC2O95347 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC2O95347 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC2O95347 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC2O95347 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC2O95347 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC2O95347 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC2O95347 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC2O95347 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC2O95347 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC2O95347 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC2O95347 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC2O95347 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC2O95347 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC2O95347 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC2O95347 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC2O95347 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC2O95347 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC2O95347 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC2O95347 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC2O95347 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC2O95347 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC2O95347 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC2O95347 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC2O95347 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC2O95347 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC2O95347 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC2O95347 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC2O95347 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC2O95347 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC2O95347 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms