Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM2O94769 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM2O94769 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM2O94769 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM2O94769 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM2O94769 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM2O94769 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM2O94769 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM2O94769 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM2O94769 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM2O94769 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM2O94769 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM2O94769 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM2O94769 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM2O94769 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM2O94769 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM2O94769 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM2O94769 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM2O94769 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM2O94769 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM2O94769 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM2O94769 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM2O94769 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECM2O94769 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ECM2O94769 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM2O94769 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM2O94769 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM2O94769 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM2O94769 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM2O94769 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM2O94769 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM2O94769 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM2O94769 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM2O94769 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM2O94769 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM2O94769 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms