Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEBLO76041 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEBLO76041 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEBLO76041 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEBLO76041 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEBLO76041 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEBLO76041 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEBLO76041 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEBLO76041 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEBLO76041 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEBLO76041 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEBLO76041 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEBLO76041 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEBLO76041 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEBLO76041 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEBLO76041 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEBLO76041 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEBLO76041 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEBLO76041 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEBLO76041 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEBLO76041 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEBLO76041 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEBLO76041 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEBLO76041 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEBLO76041 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEBLO76041 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEBLO76041 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEBLO76041 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEBLO76041 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEBLO76041 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEBLO76041 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEBLO76041 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEBLO76041 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEBLO76041 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEBLO76041 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEBLO76041 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEBLO76041 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEBLO76041 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEBLO76041 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEBLO76041 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEBLO76041 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEBLO76041 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEBLO76041 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEBLO76041 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEBLO76041 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEBLO76041 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEBLO76041 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEBLO76041 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms