Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms